تبعد عن حصن الاخيضر ٥ كم ويعود تاريخ بنائها الى القرن الخامس الميلادي، و تعتبر اقدم كنيسه في الشرق الأوسط بنيت من احجار الكلس و تم تثبيتها بمادة الجص.
وكنيسة الاقيصر مستوطنة مسيحية قديمة جدا اتخذها وسط الصحراء خوفا من السلطة حينذاك و كانت تأخذ الماء من.
من الآبار الجوفية وكانت الدولة الساسانية متسامحة معهم نكاية بالرومان ولا تزال آثاره الكتابات الارامية واضحة على جدرانها إضافة إلى وجود المذبح الذي يتجه نحو القدس وهو مرتفعة باقي أرضية الكنيسة وشاهد الآثار القبور الموجودة قرب الكنيسة الرحمن الذين يعتكف فيها واصل الكلمة القيصر محلية وهي تصغير قصر.
